Berdasarkan visi dan misi Program Studi, maka tujuan Program Studi Ilmu Komputer adalah:

1. Menghasilkan lulusan ilmu komputer yang profesional di bidang software engineering, networking, multimedia dan komputasi yang mandiri, berbudi pekerti luhur, serta mampu bersaing di dunia kerja.
2. Mengembangkan kurikulum untuk tersedianya mata kuliah yang tepat dengan mengacu pada standar kurikulum nasional untuk memenuhi kebutuhan masyarakat saat ini dan masa mendatang.
3. Menghasilkan penelitian yang bermanfaat bagi pengembangan ilmu pengetahuan dengan memperhatikan perkembangan teknologi dan ilmu pengetahuan terkini.
4. Menghasilkan kegiatan pengabdian kepada masyarakat yang berlandaskan pada tropical rain forest yang memberikan kontribusi pada peningkatan kesejahteraan masyarakat di Kalimantan.